Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP5F1P24539 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms