Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSHP23434 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSHP23434 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSHP23434 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCSHP23434 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCSHP23434 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCSHP23434 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCSHP23434 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCSHP23434 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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