Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCNA2P20248 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCNA2P20248 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms