Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDSP20132 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDSP20132 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDSP20132 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDSP20132 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDSP20132 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDSP20132 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SDSP20132 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDSP20132 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDSP20132 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDSP20132 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDSP20132 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDSP20132 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDSP20132 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDSP20132 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDSP20132 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SDSP20132 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDSP20132 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDSP20132 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDSP20132 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDSP20132 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDSP20132 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SDSP20132 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDSP20132 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDSP20132 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDSP20132 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SDSP20132 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDSP20132 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDSP20132 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SDSP20132 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDSP20132 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDSP20132 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms