Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT4P19013 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT4P19013 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT4P19013 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT4P19013 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT4P19013 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT4P19013 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT4P19013 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT4P19013 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT4P19013 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT4P19013 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT4P19013 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT4P19013 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms