Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPI1P17947 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPI1P17947 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPI1P17947 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPI1P17947 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPI1P17947 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPI1P17947 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPI1P17947 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPI1P17947 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPI1P17947 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPI1P17947 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPI1P17947 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPI1P17947 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms