Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN2P17655 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms