Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYN1P17600 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYN1P17600 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYN1P17600 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYN1P17600 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYN1P17600 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYN1P17600 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYN1P17600 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYN1P17600 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYN1P17600 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYN1P17600 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYN1P17600 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYN1P17600 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms