Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA2P17301 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms