Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMN1P16949 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMN1P16949 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMN1P16949 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMN1P16949 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STMN1P16949 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STMN1P16949 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STMN1P16949 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STMN1P16949 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STMN1P16949 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STMN1P16949 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STMN1P16949 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms