Protein–RNA interactions for Protein: P16389

KCNA2, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA2P16389 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA2P16389 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA2P16389 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA2P16389 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA2P16389 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA2P16389 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA2P16389 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNA2P16389 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNA2P16389 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNA2P16389 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms