Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHN1P15882 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHN1P15882 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHN1P15882 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHN1P15882 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHN1P15882 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHN1P15882 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHN1P15882 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHN1P15882 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHN1P15882 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHN1P15882 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHN1P15882 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN1P15882 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN1P15882 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN1P15882 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN1P15882 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN1P15882 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHN1P15882 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN1P15882 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN1P15882 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN1P15882 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN1P15882 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN1P15882 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN1P15882 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHN1P15882 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHN1P15882 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHN1P15882 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHN1P15882 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms