Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A1P13866 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A1P13866 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms