Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF5P13349 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF5P13349 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF5P13349 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF5P13349 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF5P13349 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF5P13349 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF5P13349 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF5P13349 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF5P13349 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYF5P13349 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYF5P13349 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF5P13349 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF5P13349 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms