Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL6A2P12110 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL6A2P12110 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms