Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COX6A1P12074 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COX6A1P12074 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COX6A1P12074 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COX6A1P12074 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COX6A1P12074 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX6A1P12074 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX6A1P12074 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COX6A1P12074 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COX6A1P12074 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms