Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEFHP12036 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEFHP12036 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFHP12036 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFHP12036 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFHP12036 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEFHP12036 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFHP12036 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFHP12036 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFHP12036 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFHP12036 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEFHP12036 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms