Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNAP12004 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNAP12004 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNAP12004 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNAP12004 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNAP12004 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCNAP12004 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNAP12004 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNAP12004 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNAP12004 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNAP12004 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNAP12004 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNAP12004 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms