Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms