Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARBP10826 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RARBP10826 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RARBP10826 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARBP10826 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARBP10826 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARBP10826 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARBP10826 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARBP10826 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARBP10826 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARBP10826 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARBP10826 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARBP10826 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARBP10826 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARBP10826 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARBP10826 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARBP10826 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARBP10826 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARBP10826 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARBP10826 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARBP10826 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARBP10826 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARBP10826 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARBP10826 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARBP10826 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARBP10826 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARBP10826 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARBP10826 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARBP10826 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARBP10826 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARBP10826 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RARBP10826 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RARBP10826 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARBP10826 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms