Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFB3P10600 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFB3P10600 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms