Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBSLP0DN79 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms