Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD3P0DMS9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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