Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATXN8OSP0DMR3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATXN8OSP0DMR3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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