Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAA2P0DJI9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms