Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM13P0DJ93 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM13P0DJ93 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms