Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CT47B1P0C2W7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CT47B1P0C2W7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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