Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC175P0C221 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC175P0C221 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC175P0C221 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms