Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C4AP0C0L4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C4AP0C0L4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms