Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms