Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBBP07437 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBBP07437 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBBP07437 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBBP07437 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBBP07437 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBBP07437 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBBP07437 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBBP07437 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBBP07437 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBBP07437 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBBP07437 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBBP07437 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBBP07437 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms