Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LPLP06858 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LPLP06858 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LPLP06858 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LPLP06858 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LPLP06858 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LPLP06858 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LPLP06858 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPLP06858 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPLP06858 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPLP06858 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LPLP06858 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPLP06858 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPLP06858 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPLP06858 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPLP06858 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms