Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYCNP04198 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYCNP04198 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYCNP04198 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYCNP04198 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYCNP04198 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYCNP04198 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYCNP04198 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYCNP04198 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYCNP04198 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYCNP04198 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYCNP04198 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYCNP04198 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYCNP04198 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MYCNP04198 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYCNP04198 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYCNP04198 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYCNP04198 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYCNP04198 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYCNP04198 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYCNP04198 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYCNP04198 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYCNP04198 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYCNP04198 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYCNP04198 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYCNP04198 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms