Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms