Protein–RNA interactions for Protein: O95936

EOMES, Eomesodermin homolog, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EOMESO95936 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EOMESO95936 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EOMESO95936 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EOMESO95936 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EOMESO95936 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EOMESO95936 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EOMESO95936 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
EOMESO95936 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EOMESO95936 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EOMESO95936 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EOMESO95936 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EOMESO95936 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EOMESO95936 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EOMESO95936 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EOMESO95936 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EOMESO95936 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EOMESO95936 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EOMESO95936 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EOMESO95936 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EOMESO95936 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EOMESO95936 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EOMESO95936 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EOMESO95936 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms