Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPAN13O95857 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms