Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms