Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms