Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG12O94817 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG12O94817 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG12O94817 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG12O94817 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG12O94817 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG12O94817 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG12O94817 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG12O94817 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms