Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABBR2O75899 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GABBR2O75899 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABBR2O75899 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms