Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA3O75764 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms