Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCATO75600 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCATO75600 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCATO75600 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCATO75600 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCATO75600 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCATO75600 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCATO75600 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCATO75600 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCATO75600 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCATO75600 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCATO75600 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCATO75600 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCATO75600 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCATO75600 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCATO75600 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCATO75600 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCATO75600 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCATO75600 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCATO75600 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCATO75600 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCATO75600 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCATO75600 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCATO75600 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms