Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSDE1O75534 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms