Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F6O75461 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F6O75461 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F6O75461 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F6O75461 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F6O75461 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F6O75461 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F6O75461 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F6O75461 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F6O75461 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms