Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22BO75396 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC22BO75396 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC22BO75396 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC22BO75396 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC22BO75396 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC22BO75396 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms