Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF253O75346 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms