Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIA4O75335 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIA4O75335 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms