Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM20BO75063 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20BO75063 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms