Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNASEH1O60930 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNASEH1O60930 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms