Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REV3LO60673 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REV3LO60673 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REV3LO60673 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REV3LO60673 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REV3LO60673 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REV3LO60673 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REV3LO60673 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REV3LO60673 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REV3LO60673 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REV3LO60673 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REV3LO60673 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
REV3LO60673 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REV3LO60673 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REV3LO60673 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REV3LO60673 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REV3LO60673 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REV3LO60673 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REV3LO60673 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REV3LO60673 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REV3LO60673 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REV3LO60673 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REV3LO60673 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REV3LO60673 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
REV3LO60673 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REV3LO60673 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REV3LO60673 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REV3LO60673 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REV3LO60673 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REV3LO60673 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REV3LO60673 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REV3LO60673 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REV3LO60673 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REV3LO60673 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REV3LO60673 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REV3LO60673 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REV3LO60673 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REV3LO60673 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REV3LO60673 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REV3LO60673 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REV3LO60673 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REV3LO60673 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REV3LO60673 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REV3LO60673 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms